ГлавнаяНаукаAlphaFold3 и белки: грибы, бактерии – прорыв в изучении

AlphaFold3 и белки: грибы, бактерии – прорыв в изучении


Ледяные загадки природы: как живые организмы преобразуют воду

AlphaFold3 и белки: грибы, бактерии – прорыв в изучении-0
Источник: naked-science.ru

Замерзание воды — это не просто физический процесс, а настоящее испытание для природы из-за высокого энергетического барьера. В естественных условиях чистая вода превращается в лед лишь при минус сорока шести градусах по Цельсию. Однако в живых организмах есть особые катализаторы, которые способны ускорить этот переход и облегчить образование кристаллов. Особенно этим отличаются определённые бактерии. Их мембранные протеины инициируют процесс кристаллизации даже при температурах, близких к минус двум градусам по Цельсию. Такой феноменальный талант оказался не только интересен исследователям, но и нашёл применение в практике.

Человечество уже давно вдохновляется этими возможностями природы. Генерация искусственного снега на лыжных трассах, управление осадками при помощи облачного сева — всё это процессы, где применяются катализаторы, инициирующие кристаллизацию водяных капель. Сейчас для посева облаков часто используют серебро в виде йодида, но у этого вещества есть свои ограничения из-за токсичности. К сожалению, бактериальные катализаторы пока не идут на промышленный широкий размах, ведь для максимальной эффективности им нужна мембрана живой клетки, и они теряют активность вне своего природного окружения.

Грибы вступают в игру: открытие нового биохимического механизма

Удивительная способность почвенных грибов синтезировать собственные белки, способствующие льдообразованию, впервые была замечена учёными ещё тридцать лет назад. Однако серьёзный рывок в понимании этого феномена произошёл только недавно, когда биологи смогли расшифровать и тщательно изучить генетический код грибов из семейства Mortierellaceae. Особенно интересным для исследователей стал вид Mortierella alpina, а также изолят из лишайника Peltigera britannica.

В ходе работы специалисты проанализировали полные геномы этих организмов в поиске участков, отвечающих за сборку специфических белков. Первое, на что обратили внимание биологи, — участки ДНК, формирующие повторяющиеся последовательности из аминокислот треонина, серина и лейцина. Такой мотив ранее уже фигурировал в молекулах, известных своим влиянием на кристаллизацию воды.

Генетический обмен: грибы перенимают опыт бактерий

Углублённый анализ выделенных фрагментов грибной ДНК показал, что у этих организмов присутствуют гены, очень похожие на бактериальный ген InaZ — ответственный за синтез льдообразующих белков у бактерий. Доля гуанина и цитозина в этих участках ДНК оказалась значительно выше, чем в остальной части хромосом грибов, что свидетельствует о чужеродном происхождении. Сравнение генетических кодов подтвердило: грибы в буквальном смысле переняли у бактерий их уникальную биохимическую технологию и интегрировали её в свои собственные клетки.

Грибной ген кодирует белки, состоящие из 606-990 аминокислот, с массой молекул от 64 до 100 килодальтон. Для сравнения, классические бактериальные протеины этого типа весят обычно около 120 килодальтон, что делает грибные молекулы более компактными.

Эксперименты с генами: проверка работоспособности и новые перспективы

Чтобы подтвердить биологическую активность обнаруженного гена, учёные ввели его в клетки кишечной палочки и пекарских дрожжей, превратив самые обычные микроорганизмы в носителей инновационного белка. Эксперименты показали впечатляющие результаты: капли раствора с такими дрожжами начинали замерзать уже при минус семи градусах по Цельсию, а генномодифицированные палочки инициировали образование льда при температуре около минус пятнадцати градусов. Для сравнения, обычная смесь воды оставалась жидкой даже при более низких температурах, вплоть до минус двадцати трёх.

Это открытие существенно расширяет горизонты применения новых белков в науке и технологии, ведь их способность работать при таких температурах позволяет сохранять уникальные свойства даже в условиях, далеких от идеальных.

AlphaFold3 раскрывает тайны структуры уникального белка

Для того чтобы получить представление о трёхмерной структуре нового белка, специалисты обратились к возможностям искусственного интеллекта — нейросети AlphaFold3. Компьютерное моделирование показало, что белковая цепочка формирует спираль чуть шире трёх нанометров, в которой 42 одинаковых витка. Особенность этой молекулы — наличие шести атомов серы на концах, благодаря чему белок образует многопрочные химические замки. Подобная плотная и устойчивая структура позволяет молекуле функционировать прямо в водной среде без опоры на клеточную мембрану.

В растворе несколько таких спиралей могут слипаться боками, формируя широкое плоское пространство — идеальную площадку для начала кристаллизации льда.

Практическое применение: новые возможности для климата и индустрии

Чистый экстракт белка, полученный из промытого мицелия, продемонстрировал свою эффективность уже в лабораторных испытаниях. Своей активностью раствор начал вызывать обледенение воды при температурах от минус пяти до минус семи градусов, не разрушаясь даже после многократных циклов замораживания и оттаивания, а также нагрева. Эти свойства делают белок отличным кандидатом для промышленных задач, где требуется высокая устойчивость биомолекул.

Итак, благодаря открытию новых льдообразующих соединений, биотехнологии получили универсальный и водорастворимый инструмент для управления влагой и кристаллизацией. Такие решения могут найти воплощение в производстве экологически чистых реагентов для искусственного снегообразования, организации процессов шоковой заморозки продуктов, хранении биоматериалов и даже криоконсервации.

Современная наука уверенно движется вперёд, раскрывая тайны взаимодействия грибов и бактерий, а открытия в этой области открывают перед человечеством поистине вдохновляющие перспективы!

Источник: naked-science.ru

Разное